秋季雨水增多，水温适宜，水质稳定，是鱼体生长最快的阶段。但秋季又是鱼病高发季节，因此，黄鳝养殖户必须注意秋季黄鳝病害的防治，稳固养殖效益。黄鳝的病害较多，其中最常见、危害严重的有肤霉病、腐皮病、寄生虫、发烧病和肠炎等。
　　肤霉病
　　此病多由于饲养密度过大和饲料不足，导致黄鳝互相残杀而致伤，感染霉菌而引起的。病鳝烦躁不安，体表长有白色棉霉状菌丝状物，很少摄食，体质瘦弱，最后清瘦大量死亡。
　　防治方法每立方米可用0.2克孔雀石绿或2克甲基蓝全池泼洒。每天1次，连续3天。
　　腐皮病
　　此病病因与肤霉病基本相同。病鳝常将头部伸出水面，体表出现大小不一的充血红斑，呈圆形、椭圈形或梅花形黄黑色斑纹，尤以腹部两侧居多，严重时表皮腐烂，形成不规则的小洞，可见肌肉下的骨骼及内脏。
　　防治方法每立方米可用有效氯30%的漂白粉1克全池泼洒，每天1次，连续3天；亦可全池泼洒红霉素水溶液，按照每立方米20万单位，每隔1天泼洒1次，连续3天见效。
　　寄生虫病
　　主要是毛细线虫侵入鳝体肠道而引起的。造成肠壁粘膜组织坏死，致使其他病菌侵入肠壁而引起发炎。病鳝体质瘦弱，食量锐减，严重时有挣扎性滚动、窜游，腹部膨大，解剖病鳝可见2～3厘米长淡红色的虫体，充满整个肠道。
　　防治方法寄生虫病可用90%晶体敌百虫5克，拌豆饼3公斤做成药饵内服杀虫。发烧病
　　此病由于放养密度过大，病鳝表现烦躁不安，头、胸部伸出水面挣扎摆动，互相纠缠，头部肿大，体表粘液积聚发酵，池水粘性增加，溶氧量减少，1～2天后出现死亡。
　　防治方法每立方米可用0.07%的硫酸铜溶液50毫升泼洒全池；亦可放入少量泥鳅吃掉残饵，并上下翻腾，减少黄鳝纠缠。
　　肠炎
　　黄鳝吃了腐败变质的食物导致消化道感染所致。病鳝表现为反应迟钝，食欲减退或不摄食，鳝体发乌变青，头部发黑，腹部出现红斑，肛门红肿，解剖病鳝，肠内无食，肠管发炎，充满黄色脓血状粘液，重者发紫，很快死亡。
　　防治方法：用磺胺咪5克，加抗坏血酸盐0.5克，拌料投喂，连喂3天；或用呋喃西林2克拌料投喂，效果颇佳。